滴蟲性攝護腺炎臨床症狀多種多樣，主要表現類似於慢性攝護腺炎，如排尿終末時疼痛、會陰部鈍痛、直腸墜脹等。急性發作時，還可出現尿頻、尿急、尿痛等尿路刺激症狀甚至發熱等。
在男性生殖系統滴蟲感染中，攝護腺的滴蟲感染發生率占 25 ％ ~70 ％。攝護腺滴蟲的檢出一般比較困難，即使在門診采集新鮮的尿液或攝護腺液標本
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進行顯微鏡下檢查，也常常需要檢查多次才能發現滴蟲。此外，攝護腺按摩取液時常給患者帶來程度不等的疼痛與不適，因此也難以反復進行。
所以，當男性發現自己既有攝護腺炎臨床症狀，抗生素治療效果又不佳時，詢問其性伴侶有無陰道滴蟲病史對該病的診治很有幫助。因為，男性的滴蟲幾乎全部來自配偶的傳染，而婦女進行陰道滴蟲檢查既方便又準確。
